Lilycle έχει μια γλυκιά, συγκινητική ιστορία γεμάτη περιεχόμενο, με χαρούμενες και ιδιαίτερα λεπτομερείς εικονογραφήσεις από τη Sakura Miwabe, και διαθέτει ένα προηγμένο σύστημα visual novel που προβάλλεται από την οπτική ενός χαρακτήρα τη φορά. Καθώς παρουσιάζεται η προοπτική κάθε χαρακτήρα, θα μπορούσε κανείς να πει ότι όλοι είναι ο πρωταγωνιστής! Όλα τα επεισόδια της ιστορίας επιλέγονται από το κύριο μενού, το οποίο είναι οργανωμένο σαν ημερολόγιο, με διαφορετικά επεισόδια διαθέσιμα σε διαφορετικές μέρες. Μόλις ολοκληρωθούν συγκεκριμένα επεισόδια, θα γίνουν διαθέσιμα νέα, επιτρέποντας στον παίκτη (εσένα!) να βιώσει τις λεπτομέρειες της πλοκής του Lilycle.

Η Yuno αγαπάει το χαμόγελο της Tamaki και θέλει εκείνη να γίνει μάρτυρας των ονείρων της που πραγματοποιούνται... όμως, καθώς δεν έχει δει πολύ την Tamaki τελευταία, η Yuno νιώθει κάπως πεσμένη. Εξαρτάται πολύ από τη Saeka, και αφού εκείνη πάντα την παρηγορεί στις στιγμές ανάγκης, η Yuno νιώθει πως μπορεί να της μιλήσει για τα προβλήματά της χωρίς κανένα άγχος.

Η Tamaki εύχεται με όλη της την καρδιά να συνεχίσει να προσέχει την Yuno, που πάντα ήταν πρώτη στην καρδιά της... αλλά οι συνθήκες γύρω της αλλάζουν, λίγο-λίγο. Άλλωστε, δεν είναι μόνο ένα κορίτσι που πρέπει να προσέχει πια.

Η Saeka υπήρξε πάντα αξιόπιστη και υποστηρικτική, και η Tamaki άρχισε να νιώθει μπερδεμένη... «Αχ... Φαίνεται πως κι αυτή πάντα χρειάζεται κάποιον στο πλευρό της...» Η Saeka εξακολουθεί να έχει ερωτικό ενδιαφέρον για την Yuno, αλλά έχει μαγευτεί από την αύρα της Tamaki, και διαπιστώνει ότι δεν μπορεί να την αφήσει μόνη.

Τελευταία, σκέφτεται αν θέλει ή όχι να προσπαθήσει να αλλάξει τον εαυτό της... Καθώς κουβεντιάζουν, πλησιάζουν, γίνονται ζηλιάρες, ντροπαλούν και γελούν... Οι διασταυρούμενες συγκινήσεις αυτών των τριών κοριτσιών επιτρέπουν σε αυτή τη ζεστή αλλά ελαφρώς πικρή ιστορία να ξεδιπλωθεί...